Muling pag-iisipan ang pagiging sensitibo ng pagsubok sa Covid-19 –?Diskarte sa pagpigil

Gamitin ang impormasyon at mga serbisyo ng NEJM Group upang maghanda na maging isang doktor, makaipon ng kaalaman, mamuno sa isang organisasyon ng pangangalagang pangkalusugan at itaguyod ang iyong pag-unlad ng karera.
Panahon na para baguhin ang ating pananaw sa pagiging sensitibo ng pagsubok sa Covid-19.Ang US Food and Drug Administration (FDA) at ang siyentipikong komunidad ay kasalukuyang halos eksklusibong tumutuon sa sensitivity ng pagtuklas, na sumusukat sa kakayahan ng isang paraan ng pagtuklas na makakita ng mga viral protein o RNA molecule.Higit sa lahat, binabalewala ng panukalang ito ang konteksto kung paano gamitin ang pagsubok.Gayunpaman, pagdating sa malawakang screening na lubhang kailangan ng Estados Unidos, ang konteksto ay mahalaga.Ang pangunahing tanong ay hindi kung gaano kahusay ang isang molekula na matutukoy sa isang sample, ngunit maaari bang epektibong matukoy ang impeksyon sa populasyon sa pamamagitan ng muling paggamit sa ibinigay na pagsubok bilang bahagi ng pangkalahatang diskarte sa pagtuklas?Ang pagiging sensitibo ng plano ng pagsubok.
Ang mga tradisyonal na programa sa pagsubok ay maaaring kumilos bilang isang uri ng Covid-19 na filter sa pamamagitan ng pagtukoy, paghihiwalay at pag-filter sa mga kasalukuyang nahawaang tao (kabilang ang mga taong walang sintomas).Ang pagsukat sa sensitivity ng isang test plan o filter ay nangangailangan sa amin na isaalang-alang ang pagsubok sa konteksto: dalas ng paggamit, sino ang ginagamit, kapag ito ay gumagana sa panahon ng proseso ng impeksyon, at kung ito ay epektibo.Ang mga resulta ay ibabalik sa oras upang maiwasan ang pagkalat.1-3
Ang trajectory ng impeksyon ng isang tao (asul na linya) ay ipinapakita sa konteksto ng dalawang programa ng pagsubaybay (mga bilog) na may magkaibang sensitivity ng analytical.Ang mababang analytical sensitivity assay ay madalas na ginagawa, habang ang mataas na analytical sensitivity assay ay bihira.Ang parehong test scheme ay maaaring makakita ng impeksyon (orange na bilog), ngunit sa kabila ng mas mababang analytical sensitivity nito, tanging ang high-frequency test lang ang makaka-detect nito sa loob ng propagation window (shadow), na ginagawa itong mas epektibong filter na Device.Ang polymerase chain reaction (PCR) detection window (berde) bago ang infectivity ay napakaikli, at ang katumbas na window (purple) na maaaring makita ng PCR pagkatapos ng impeksyon ay napakahaba.
Ang pag-iisip tungkol sa mga epekto ng paulit-ulit na paggamit ay isang konseptong pamilyar sa mga clinician at mga ahensya ng regulasyon;ito ay ginagamit sa tuwing sinusukat natin ang bisa ng isang plano sa paggamot sa halip na isang dosis.Sa pinabilis na pag-unlad o pag-stabilize ng mga kaso ng Covid-19 sa buong mundo, kailangan nating agad na ilipat ang ating atensyon mula sa makitid na atensyon sa analytical sensitivity ng pagsubok (ang mas mababang limitasyon ng kakayahang makita ng tama ang konsentrasyon ng maliliit na molekula sa sample. ) at ang pagsusulit Ang programa ay may kaugnayan sa pagiging sensitibo ng pagtuklas ng mga impeksyon (naiintindihan ng mga nahawaang tao ang posibilidad na mahawa sa oras upang salain sila mula sa populasyon at maiwasan ang pagkalat sa iba).Ang point-of-care test, na sapat na mura at maaaring gamitin nang madalas, ay may mataas na sensitivity para sa pag-detect ng mga impeksyon na nagsasagawa ng napapanahong pagkilos nang hindi kinakailangang maabot ang analytical na limitasyon ng baseline test (tingnan ang figure).
Ang mga pagsubok na kailangan namin ay sa panimula ay naiiba sa mga klinikal na pagsubok na kasalukuyang ginagamit, at dapat na masuri ang mga ito sa ibang paraan.Ang klinikal na pagsusuri ay idinisenyo para sa mga taong may mga sintomas, hindi nangangailangan ng mababang gastos, at nangangailangan ng mataas na pagiging sensitibo sa analytical.Hangga't may pagkakataon sa pagsubok, maaaring maibalik ang isang tiyak na klinikal na diagnosis.Sa kabaligtaran, ang mga pagsusuri sa epektibong mga programa sa pagsubaybay upang bawasan ang paglaganap ng mga respiratory virus sa populasyon ay kailangang magbalik ng mga resulta nang mabilis upang limitahan ang asymptomatic transmission, at dapat ay sapat na mura at madaling gawin upang payagan ang madalas na pagsusuri—maraming beses sa isang linggo.Ang pagkalat ng SARS-CoV-2 ay lumilitaw na magaganap ilang araw pagkatapos ng pagkakalantad, kapag ang viral load ay umabot sa pinakamataas nito.4 Ang puntong ito sa oras ay nagpapataas ng kahalagahan ng mataas na dalas ng pagsubok, dahil ang pagsubok ay dapat gamitin sa simula ng impeksiyon upang maiwasan ang patuloy na pagkalat at mabawasan ang kahalagahan ng pagkamit ng napakababang limitasyon ng molekular ng karaniwang pagsubok.
Ayon sa ilang pamantayan, nabigo ang benchmark na karaniwang clinical polymerase chain reaction (PCR) na pagsubok kapag ginamit sa mga protocol ng pagsubaybay.Pagkatapos ng koleksyon, ang mga sample ng PCR ay karaniwang kailangang dalhin sa isang sentralisadong laboratoryo na binubuo ng mga eksperto, na nagpapataas ng mga gastos, nagpapababa ng dalas, at maaaring maantala ang mga resulta ng isa hanggang dalawang araw.Ang gastos at pagsisikap na kinakailangan upang masuri gamit ang mga karaniwang pagsusuri ay nangangahulugan na karamihan sa mga tao sa US ay hindi pa nasusuri, at ang maikling oras ng turnaround ay nangangahulugan na kahit na ang kasalukuyang mga pamamaraan ng pagsubaybay ay talagang matukoy ang mga nahawaang tao, maaari pa rin nilang maikalat ang impeksiyon sa loob ng ilang araw.Dati, nililimitahan nito ang epekto ng quarantine at pagsubaybay sa contact.
Tinatantya ng Centers for Disease Control and Prevention (CDC) na pagsapit ng Hunyo 2020, ang bilang ng mga kaso ng Covid-19 na natukoy sa United States ay magiging 10 beses sa bilang ng mga kaso na natukoy.5 Sa madaling salita, sa kabila ng pagsubaybay, ang mga testing scheme ngayon ay maaari lamang makakita ng sensitivity na 10% sa pinakamaraming at hindi maaaring gamitin bilang isang Covid filter.
Bilang karagdagan, pagkatapos ng naililipat na yugto, ang RNA-positive long tail ay malinaw na inilarawan, na nangangahulugang, kung hindi karamihan, maraming tao ang gumagamit ng mataas na analytical sensitivity upang makita ang impeksiyon sa panahon ng regular na pagsubaybay, ngunit hindi na sila nakakahawa sa oras ng pagtuklas. .Detection (tingnan ang larawan).2 Sa katunayan, natuklasan ng isang kamakailang survey ng The New York Times na sa Massachusetts at New York, higit sa 50% ng mga impeksiyon na natuklasan sa pamamagitan ng pagsubaybay na nakabatay sa PCR ay mayroong PCR cycle threshold sa kalagitnaan ng 30s hanggang 30s., Isinasaad na mababa ang bilang ng viral RNA.Bagama't ang mababang bilang ay maaaring magpahiwatig ng maaga o huli na impeksyon, ang mas mahabang tagal ng RNA-positive na mga buntot ay nagpapahiwatig na karamihan sa mga nahawaang tao ay natukoy pagkatapos ng panahon ng impeksyon.Mahalaga sa ekonomiya, nangangahulugan din ito na kahit na pumasa sila sa nakakahawang yugto ng paghahatid, libu-libong tao ang naka-quarantine pa rin sa loob ng 10 araw pagkatapos ng RNA-positive test.
Upang epektibong matigil ang pandemyang Covid filter na ito, kailangan nating subukan ito upang paganahin ang isang solusyon na nakakakuha ng karamihan sa mga impeksyon ngunit nakakahawa pa rin.Ngayon, ang mga pagsubok na ito ay umiiral sa anyo ng mabilis na pag-ilid na daloy ng antigen na mga pagsubok, at ang mabilis na pag-ilid na mga pagsubok sa daloy batay sa teknolohiya sa pag-edit ng gene ng CRISPR ay malapit nang lumitaw.Napakamura ng mga naturang pagsusuri (<5 USD), sampu-sampung milyon o higit pa sa mga pagsubok ang maaaring isagawa bawat linggo, at maaaring gawin sa bahay, na nagbubukas ng pinto sa isang epektibong solusyon sa pag-filter ng Covid.Ang lateral flow antigen test ay walang amplification step, kaya ang limitasyon sa pagtuklas nito ay 100 o 1000 beses kaysa sa benchmark test, ngunit kung ang layunin ay tukuyin ang mga taong kasalukuyang kumakalat ng virus, ito ay higit na hindi nauugnay.Ang SARS-CoV-2 ay isang virus na maaaring mabilis na lumaki sa katawan.Samakatuwid, kapag positibo ang benchmark na resulta ng PCR test, mabilis na lalago ang virus.Sa oras na iyon, maaaring tumagal ng ilang oras sa halip na mga araw para lumaki ang virus at maabot ang threshold ng pagtuklas ng mura at mabilis na instant na pagsubok na kasalukuyang magagamit.Pagkatapos nito, kapag nakakuha ang mga tao ng mga positibong resulta sa parehong mga pagsusuri, maaari silang asahan na nakakahawa (tingnan ang figure).
Naniniwala kami na ang mga programa sa pagsusuri sa pagsubaybay na maaaring putulin ang sapat na mga chain ng transmission upang bawasan ang transmission ng komunidad ay dapat magdagdag sa halip na palitan ang aming kasalukuyang mga klinikal na diagnostic na pagsusuri.Maaaring samantalahin ng isang mapanlikhang diskarte ang dalawang pagsubok na ito, gamit ang malakihan, madalas, mura at mabilis na pagsusuri upang mabawasan ang mga paglaganap, 1-3 gamit ang pangalawang mabilis na pagsusuri para sa iba't ibang protina o paggamit ng benchmark na PCR test upang kumpirmahin ang positibong resulta.Ang kampanya ng kamalayan sa publiko ay dapat ding maghatid ng anumang uri ng negatibong panukalang pagsubok na hindi kinakailangang nagpapahiwatig ng kalusugan, upang hikayatin ang patuloy na pagdistansya mula sa ibang tao at ang pagsusuot ng mga maskara.
Ang Abbott BinaxNOW Emergency Use Authorization (EUA) ng FDA sa huling bahagi ng Agosto ay isang hakbang sa tamang direksyon.Ito ang kauna-unahang mabilis, walang instrumentong pagsusuri ng antigen upang makakuha ng EUA.Ang proseso ng pag-apruba ay binibigyang-diin ang mataas na sensitivity ng pagsusulit, na maaaring matukoy kung kailan ang mga tao ay pinaka-malamang na magkalat ng impeksyon, sa gayon ay binabawasan ang kinakailangang limitasyon sa pagtuklas ng dalawang order ng magnitude mula sa PCR benchmark.Ang mga mabilis na pagsubok na ito ay kailangan na ngayong mabuo at maaprubahan para sa paggamit sa bahay upang makamit ang isang tunay na programa sa pagsubaybay sa buong komunidad para sa SARS-CoV-2.
Sa kasalukuyan, walang landas ng FDA upang suriin at aprubahan ang pagsusuri para sa paggamit sa isang plano ng paggamot, hindi bilang isang pagsubok, at walang potensyal na pampublikong kalusugan upang bawasan ang paghahatid ng komunidad.Ang mga ahensya ng regulasyon ay nakatuon lamang sa mga klinikal na diagnostic na pagsusuri, ngunit kung ang kanilang nakasaad na layunin ay bawasan ang pagkalat ng virus sa komunidad, maaaring ilapat ang mga bagong tagapagpahiwatig sa mga pagsusuri sa pagsusuri batay sa epidemiological framework.Sa diskarte sa pag-apruba na ito, ang mga trade-off sa pagitan ng dalas, limitasyon sa pagtuklas at oras ng turnaround ay maaaring asahan at naaangkop na masuri.1-3
Upang talunin ang Covid-19, naniniwala kami na ang FDA, CDC, National Institutes of Health at iba pang ahensya ay dapat hikayatin ang structured na pagsusuri ng mga pagsubok sa konteksto ng mga nakaplanong programa sa pagsubok upang malaman kung aling test program ang makakapagbigay ng pinakamahusay na Covid filter .Ang madalas na paggamit ng mura, simple, at mabilis na mga pagsubok ay makakamit ang layuning ito, kahit na ang kanilang pagiging sensitibo sa analytical ay mas mababa kaysa sa mga benchmark na pagsubok.1 Ang ganitong pamamaraan ay makakatulong din sa atin na maiwasan ang pag-unlad ng Covid.
Boston Harvard Chenchen School of Public Health (MJM);at University of Colorado Boulder (RP, DBL).
1. Larremore DB, Wilder B, Lester E, atbp. Para sa pagsubaybay sa COVID-19, ang sensitivity ng pagsubok ay pangalawa lamang sa dalas at oras ng turnaround.Setyembre 8, 2020 (https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.06.22.20136309v2).Preprint.
2. Paltiel AD, Zheng A, Walensky RP.Suriin ang diskarte sa screening ng SARS-CoV-2 upang payagan ang ligtas na muling pagbubukas ng mga kampus ng unibersidad sa United States.JAMA Cyber ​​​​Open 2020;3(7): e2016818-e2016818.
3. Chin ET, Huynh BQ, Chapman LAC, Murrill M, Basu S, Lo NC.Ang dalas ng regular na pagsusuri para sa COVID-19 sa mga high-risk na kapaligiran para mabawasan ang mga outbreak sa lugar ng trabaho.Setyembre 9, 2020 (https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.04.30.20087015v4).Preprint.
4. He X, Lau EHY, Wu P, atbp. Ang dinamika ng oras ng pagkalat ng virus at kapasidad ng paghahatid ng COVID-19.Nat Med 2020;26:672-675.
5. Mga Sentro para sa Pagkontrol at Pag-iwas sa Sakit.Transcript ng na-update na briefing sa telepono ng CDC tungkol sa COVID-19.Hunyo 25, 2020 (https://www.cdc.gov/media/releases/2020/t0625-COVID-19-update.html).
Ang trajectory ng impeksyon ng isang tao (asul na linya) ay ipinapakita sa konteksto ng dalawang programa ng pagsubaybay (mga bilog) na may magkaibang sensitivity ng analytical.Ang mababang analytical sensitivity assay ay madalas na ginagawa, habang ang mataas na analytical sensitivity assay ay bihira.Ang parehong test scheme ay maaaring makakita ng impeksyon (orange na bilog), ngunit sa kabila ng mas mababang analytical sensitivity nito, tanging ang high-frequency test lang ang makaka-detect nito sa loob ng propagation window (shadow), na ginagawa itong mas epektibong filter na Device.Ang polymerase chain reaction (PCR) detection window (berde) bago ang infectivity ay napakaikli, at ang katumbas na window (purple) na maaaring makita ng PCR pagkatapos ng impeksyon ay napakahaba.


Oras ng post: Mar-11-2021